1/ Interacciones entre bacterias tioautótrofas-invertebrados en modelos quimiosintéticos.
Buen númerode organismos marinos que viven en medios reductores, forman asociaciones simbióticas con bacterias. En el laboratorio, logramos controlar el crecimiento y desarrollo del bivalvo litoral Codakiaorbicularis, asociado a una bacteria sulfo-oxidante intracelular que coloniza sus branquias. De manera general, los bivalvos tropicales de la familia de Lucinidae ofrecen perspectivas interesantes como las que se encuentran realizadas en nuestro equipo sobre la plasticidad celular y tisular de la branquia durante un estrés prolongado o sobre la evolución de la población simbiótica intracelular en individuos sin alimentación. Esta familia de bivalvos controlable en el laboratorio, se ha vuelto un modelo esencial para comprender la simbiosis de organismos que viven en las profundidades de los océanos, como son las fuentes hidrotermales o las surgencias frías. Este tipo de interacción que implica bacterias sulfo-oxidantes, también ha sido estudiado en otros invertebrados que colonizan medios reducidos y albergan bacterias thioautotrófas ectosimbióticas, como es el caso de algunos nemátodos o de otros organismos (protozoarios, briozoarios, bivalvos, etc.) que colonizan sustratos orgánicos hundidos como sustratos vegetales (woodfalls) o las vértebras de cetáceos (whalefalls).

2/ Organización y funcionamiento del manglar en relación con sus especies sedentarias.
Esta temática concierne tanto a vertebrados (Peces), invertebrados (Moluscos), protistas animales y vegetales (vorticelas, diatomeas, etc.) que a microorganismos (eubacterias y arqueas). Se trata de comprender mejor el funcionamiento del ecosistema manglar basándose por un lado en el estudio de los ciclos geoquímicos implicados en la flora procarionte compleja encontrada en los sedimentos del manglar (ciclo del nitrógeno, de la zufre y de carbono) asícomo en los flujos existentes entre las especies sedentarias que residen en este ecosistema marino. Es una temática pluridisciplinaria (química, geoquímica, física, biología) que representará un eje importante de investigación para los próximosaños, el cual se basará principalmente en el estudio de procariontes y en particular las arqueas mesófilas gigantes (Thaumarchées) encontradas recientemente por nuestro equipo en este medio. El manglar es un ecosistema que representa una biodiversida excepcional para este tipo de organismos con una biomasa importante y cuyoimpacto sobre la organización y funcionamiento de este ecosistema falta por descubrir.