MS1 premier semestre (275h)

UEO11 : Introduction aux milieux intertropicaux
UEO12 : Outils
UEP11 : Ècosystèmes et environnements terrestres et marins
UEC MS1 :

• OIM (Outil informatique et multimédia)
  
• LVE Anglais à orientation scientifique (dominante : domaine de la biodiversité tropicale)
  
• Méthodologie documentaire
  

MS2 deuxième semestre (275h)

UEO21 : Ecophysiologie animale et végétale
UEO22 : Dynamique et génétique des populations
Option UEP21A : Fonctionnement biologique et physico-chimique des sols
Option UEP21B : Pollution terrestre et marine
UEC MS2 :

• OIM (Outil informatique et multimédia)
• LVE Anglais à orientation scientifique (dominante : domaine de la biodiversité tropicale)
• Enseignement libre (au choix) :
  • Initiation aux techniques de prélèvements et de relevés en plongée scientifique
  • Ethnobotanique caraïbéenne
    

MS3 troisième semestre (160h)

UEO31 : Traitement des données statistiques appliquées aux données expérimentales
UEO32 : Biogéographie et conservation des systèmes naturels et insulaires
Parcours terrestre
UEP31T : Écologie des forêts tropicales
UEP32T : Écosystèmes terrestres exploités et agrosystèmes
Parcours marin
UEP31M : Écologie marine
UEP32M : Ressources marines et aquacoles

MS4 quatrième semestre (Stage)

STAGE :
MEMOIRE :
SOUTENANCE :

MS1 (275 h) :

UEO11 : Introduction aux milieux intertropicaux (50 h)

Composantes de l'environnement climatique intertropical (12 heures)

Biodiversité de la zone intertropicale (13 heures)

• La notion de biodiversité. Les variations spatiales de la biodiversité terrestre et ses causes. Les grands biomes terrestres tropicaux.
• Organisation de la biodiversité en milieu marin : gradient latitudinal, gradient de surface / profondeur, la rupture Indopacifique / Atlantique.
  

• Statistiques descriptives unidimensionnelles et bidimensionnelles
• Initiation aux séries chronologiques
• Protocole et dispositifs  expérimentaux
• Outils d'analyse statistique des dispositifs expérimentaux

• Introduction et notions fondamentales sur les images numériques
• Applications de l'image (télédétection, surveillance, indexation...)
• Amélioration d'image (histogrammes et transformations ponctuelles, filtrage)
• Segmentation d'images et caractérisation de régions
• Classification bayésienne
• Classification automatique
• Utilisation critique de logiciels d'images

UEP11 : Écosystèmes et environnements terrestres et marins (127h : 65h cours + 23h TD + 39h TP)

Écologie générale (37 heures)

• Organisation et dynamique des écosystèmes
• Écologie numérique (structure et dynamique des communautés et des populations)

• Étude de 2 écosystèmes marins tropicaux – Techniques d’études de terrain :
  • peuplements ichtyologiques de la mangrove
  • communautés d’un herbier de Phanérogames marines

Écologie terrestre (30 heures)

• Écologie de la végétation
• les grands écosystèmes terrestres tropicaux : structure spatiale et fonctionnement
• Formation et évolution des sols

Hydrobiologie (30 heures)

• Caractéristiques du milieu physique – Faciès hydromorphodynamiques
• Stratégies d’échantillonnage – Systématique – Organisation des populations et des peuplements
• Relations espèces-milieu
• Les grands problèmes de gestion des eaux douces aux Antille

Outil informatique et multimédia (12 heures)

• Mise en oeuvre de logiciels de traitement statistique et d’analyse de données (SYSTAT – R)

Langue vivante étrangère (12 heures)

• Consolidation des acquis et approfondissements
• Développement de la maîtrise et de l’autonomie langagières
• Anglais de spécialité.
• Supports : The New Scientist, Scientific American, The Economist, Time , Newsweek  et cassettes (communications scientifiques)

Méthodologie documentaire (24 heures) 

• Recherche documentaire – Utilisation de logiciels bibliographiques (Endnote) et de traitement de texte scientifique
  

MS2 (275 h) :

UEO21 : Écophysiologie animale et végétale (75h cours + 5h TD)

• Chémoréception et phéromones chez les organismes marins - rythmes biologiques - la température : effets et régulation - osmorégulation et économie d’eau ;
• Symbiose : moyen d'acquisition de voies métaboliques nouvelles ; Stabilité, spécificité et reconnaissance ; Régulation de la population symbiotique ; Symbiose et évolution ; Symbiose algues-minéraux : les cas des organismes récifaux ;
• Coraux, Zooxanthelles, Symbiose, récifs coralliens ;
• Réponses photosynthétiques des plantes aux facteurs environnementaux et adaptation des plantes (rayonnement, température, N, eau, hydromorphie, sécheresse) ;
• Adaptation des plantes aux sels et à l'hydromorphie (aspects écophysiologiques et moléculaires)

UEO22 : Dynamique et génétique des populations (35h cours + 26h TD + 16h TP)

• Caractéristiques des populations ;
• Méthodes d’étude – Stratégies d’échantillonnage ;
• Répartition spatiale – Analyse démographique ;
• Croissance – Mortalité

Génétique des populations (30 heures)

• Dérive génétique
• Sélection naturelle
• Génétique quantitative

Option UEP21A : Fonctionnement biologique et physiologique des sols (58h cours + 12h TD)

Constituants minéraux et organiques des sols (26 heures)

• Géochimie de l’altération, formation et propriétés des constituants minéraux secondaires fins. Distribution des grands types de sols tropicaux et de leurs propriétés physiques et physico-chimiques ;
• Constituants organiques des sols, cycles du carbone et de l’azote, manipulation anthropique.

Activités biologiques des sols (24 heures)

• Stratégies adaptatives des organismes vivants du sol et domaines fonctionnels des organismes régulant les propriétés des sols (organismes ingénieurs) : rhizosphère, drilosphère, termitosphère. Effets de la macrofaune du sol sur les propriétés physiques des sols et les cycles du carbone et de l’azote ;
• Activités microbiologiques fonctionnels ;
• Impact des micro-organismes rhizosphériques sur les propriétés physiques des sols

Transferts de masse et d'énergie dans les sols et aux interfaces (20 heures)

• Fonctions du sol pour les végétaux : ancrage, réservoir d'eau, source de nutriments minéraux et degré d'ouverture des écosystèmes, altérations anthropiques (dont érosion) ;
• Analyse et Modélisation des transferts de masse et d’énergie dans le sol et aux interfaces (sol - atmosphère, sol - hydrosystèmes) et à différentes échelles (locale, séquence, bassins versants, continents).

Option UEP21B : Pollution terrestre et marine (50h cours + 20h TD)

Pollution marine tropicale (28 heures)

• Les grands types de pollution en milieu marin : pollution organique, nitrates et phosphates, détergents, hydrocarbures, pesticides et autres molécules organiques de synthèse, métaux lourds et métalloïdes, radionucléides, pollutions d’origine physique et mécanique, pollutions d’origines biologique.
• Impact sur les organismes et écosystèmes marins tropicaux

Écotoxicologie (26 heures)

• Méthodes d’étude d’évaluation de la toxicité d’un polluant - Les bioessais en laboratoire - Effets chroniques et aigus- Détermination de CL50 et DL50- Effets sur les organismes et les écosystèmes - Indicateurs de contamination – Les mécanismes de détoxication- Les biomarqueurs
• Les TD se feront sous la forme d’analyse de publications scientifiques

Traitement des déchets et législation (16 heures)

• Gestion et traitement des déchets
• Législation

UEC MS2 : OIM + LVE + Enseignements libres

Outil informatique et miltimédia (12 heures)

• Mise en oeuvre de logiciels de dynamique des populations (FISAT – MIX)
• Mise en oeuvre de Systèmes d’information géographique SIG (Geoconcept – Map Info)

Langue vivante étrangère (12 heures)

• Consolidation des acquis et approfondissements
• Développement de la maîtrise et de l’autonomie langagières
• Anglais de spécialité.
• Supports : The New Scientist, Scientific American, The Economist, Time , Newsweek  et cassettes (communications scientifiques)

Enseignements libres (24 heures) 

• Ehtnopharmacologie : ethnobotanique tropicale - connaissance générale du végétal, usage alimentaire et industriel des plantes caraïbéennes, modes de culture, modes d'utilisation
• Initiation aux techniques de prélèvements et de relevés en plongée scientifique : place de la plongée dans les techniques d'études du milieu marin - les nouveaux outils à la disposition des scientifiques (plongée aux mélanges gazeux NITROX, TRIMIX), les appareils à circuit germé et semi-fermés - techniques de cartographie sous-marine de relevés et de prélèvements (transects et quadrats)
• Stages non obligatoires

MS3 (160 h) :

UEO31 : Traitement de données statistiques appliquées aux données expérimentales (30h cours)

Analyse de données (30 heures)

• Analyse en composantes principales
• Analyse Factorielle des correspondances
• Méthodes de classification
• Analyse canonique et régression multiple
• Analyse discriminante
• Modèles log-linéaires
• Répartition spatiale et lois de dénombrement
• Tests de dispersion spatiale

UEO32 : Biogéographie et conservation des systèmes naturels et insulaires (50h cours)

Biogéographie et conservation du patrimoine naturel insulaire (30 heures)

• Phytogéographie et communautés végétales dans les systèmes insulaires
• Chronologie et histoire des peuplements insulaires
• Stratégies adaptatives ; Biodiversité (définitions, mesures, théories et implications) ; Biodiversité et perturbations (naturelles ou anthropiques)
• Biologie de la conservation (populations, peuplements et diversité)
• Evolutions et archipels (mécanismes, vicariance, endémisme…)

Techniques palliatives pour la conservation des écosystèmes marins tropicaux (10 heures)

• Repeuplement du milieu  par des juvéniles ("hatcheries")
• Les récifs artificiels
• La restauration des habitats
• Les aires marines protégées

Migrations des organismes marins ; conservation de la biodiversité et de l'habitat marins tropicaux (10 heures)

• Migrations : trophiques, génésiques, thermiques, verticales ; amphidromie, anadromie et catadromie
• Conservation, éducation et contrôle démographique

PARCOURS TERRESTRE (T)

UEP31T : Écologie des forêts tropicales (40h cours)

Écologie forestière (25 heures)

• L’arbre : rappels architecturaux , anatomiques et histologiques ; dendrométrie, démographie, dynamique des populations d’arbres ; le microclimat forestier ; les sols et les humus forestiers ;
• la communauté forestière : structuration spatiale, adaptations et types biologiques chez les végétaux forestiers, tempéraments des arbres, flores forestières, faune du sol, interactions plantes/animaux
• la dynamique forestière :  cycle svlvigénétique, dispersion/établissement des diaspores, perturbations/résilience

Écophysiologie forestière (15 heures)

• Diversité fonctionnelle de l'utilisation du carbone, de l'azote et de l'eau à l'échelle des arbres et des peuplements ;
• Diversité et fonctionnement des symbioses végétales à l'échelle de l'arbre et du peuplement ;

UEP32T : Écosystèmes terrestres exploités et agrosystèmes (40h cours)

Fonctionnement global de l'écosystème cultivé (16 heures)

• Les grandes familles d’écosystèmes cultivés ;
• Productivité et bilans environnementaux ;
• Techniques culturales : rôles et fonctions ;
• Méthodes générales et outils d’analyse : typologie, diagnostic agronomique, schéma d’élaboration du rendement ;
• Modélisation du fonctionnement des cultures.

Amélioration de la durabilité des systèmes de production - stratégies de systèmes et utilisation de la biodiversité (20 heures)

• Elaboration de systèmes de production durables – stratégies de base ;
• Diversification variétale

La conception de systèmes de cultures innovants (4 heures)

• Les différentes approches : prototypage, expérimentation, conception assistée par modèle ;
• L’évaluation multicritères ;
• Conditions d’adoption par les agriculteurs.

PARCOURS MARIN (M)

UEP31M : Écologie marine (40h cours)

Écosystèmes infralittoraux (25 heures)

• Récifs coralliens : Qu’est-ce qu’un récif corallien ? Les récifs du passé, les récifs actuels. Les coraux bioconstructeurs du récif : biologie, taxinomie et évolution.
• L’écosystème récifal
• Les récifs coralliens : formation, facteurs de contrôle de leur évolution, biogéographie. Rôles écologique et socio-économique des récifs, menaces et gestion
• Les peuplements de poissons récifaux
• Herbiers de Phanérogames marines : Origine et distribution géographique des Phanérogames marines – Biologie des Phanérogames marines – les autres compartiments de l’écosystème – Le fonctionnement de l’écosystème – l’usage des Phanérogames marines par l’homme

Écosystèmes littoraux (15 heures)

• Le domaine paralique : diversité morphologique, géochimique et sédimentaire, unité biologique des milieux paraliques, concept du confinement, zonation biologique ; principales unités fonctionnelles présentes, stratégies adaptatives ; applications
• La mangrove : caractéristiques générales de l'écosystème ; particularités de la mangrove dans la région Caraïbe ; recherches en cours

UEP32M : Ressources marines et aquacoles (40h cours)

Aquaculture tropicale (20 heures)

• L’aquaculture et sa part croissante dans les apports de produits aquatiques, émergence de nouvelles productions, enjeux pour une activité durable
• Principes d’élevage en crevetticulture (chevrette: Macrobrachium rosenbergii), et en pisciculture (espèces natives: loup Dicentrarchus labrax et daurade Sparus aurata, Centropomus sp et introduites: ombrine tropicale: Scianops ocellata et tilapia Oreochromis mossambica)
• Interrelations aquaculture - environnement

Pêcheries tropicales (20 heures)

• Fonctionnement des pêcheries tropicales : Les pêcheries récifales et leur aménagement - Les autres types de pêcheries (pêches profondes et pêches pélagiques)
• Analyse de quelques indicateurs généraux des pêcheries antillaises
• Évaluation des stocks de poissons tropicaux
• Biologie des peuplements de poissons récifaux : croissance, reproduction, ponte

MS4 (6 mois) :

Stage (5 mois)

Professionnel (l'étudiant est encadré par un enseignant tuteur durant son stage)

• Entreprise
• Bureaux d'étude
• Collectivités

Recherche

• Stage de recherche dans un laboratoire universitaire ou d'organisme de recherche

Rédaction mémoire de stage (1 mois) et soutenance devant jury